Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN23Q96B33 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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