Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRSK1Q8TDC3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms