Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms