Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms