Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL35Q6PF15 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms