Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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ZNF239Q16600 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF239Q16600 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF239Q16600 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF239Q16600 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF239Q16600 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF239Q16600 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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