Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSRP2Q16527 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms