Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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