Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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