Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms