Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms