Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms