Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MVDP53602 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MVDP53602 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms