Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA4P51532 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA4P51532 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms