Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IQGAP1P46940 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IQGAP1P46940 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms