Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms