Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms