Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LIAS-210ENST00000638451 1159 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL606469.1-201ENST00000443224 892 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SERBP1P6-201ENST00000507707 932 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MS4A6A-216ENST00000532169 1136 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SPCS1-205ENST00000602728 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AP000345.2-201ENST00000608615 1081 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC239585.2-202ENST00000624629 434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms