Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HRCP23327 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HRCP23327 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HRCP23327 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HRCP23327 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HRCP23327 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HRCP23327 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HRCP23327 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HRCP23327 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HRCP23327 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms