Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLA1P09884 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLA1P09884 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLA1P09884 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLA1P09884 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLA1P09884 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLA1P09884 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLA1P09884 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
POLA1P09884 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
POLA1P09884 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLA1P09884 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLA1P09884 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLA1P09884 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLA1P09884 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLA1P09884 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLA1P09884 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLA1P09884 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLA1P09884 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLA1P09884 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLA1P09884 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms