Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms