Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms