Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms