Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCC13Q9NSE7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms