Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELL3Q9HB65 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms