Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARXQ96QS3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms