Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AVL9Q8NBF6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms