Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms