Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms