Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RWDD4Q6NW29 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms