Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP2Q16527 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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