Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA2Q15822 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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