Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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