Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP1A4Q13733 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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