Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNIP3Q12983 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms