Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms