Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX1P83916 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX1P83916 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX1P83916 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms