Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG7P83436 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG7P83436 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG7P83436 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG7P83436 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG7P83436 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms