Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms