Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPAP53621 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPAP53621 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPAP53621 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPAP53621 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms