Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGDSP41222 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms