Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRBP28702 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRBP28702 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRBP28702 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRBP28702 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRBP28702 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRBP28702 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRBP28702 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRBP28702 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRBP28702 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRBP28702 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRBP28702 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRBP28702 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRBP28702 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RXRBP28702 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RXRBP28702 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RXRBP28702 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RXRBP28702 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RXRBP28702 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms