Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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