Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms