Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EFNA1P20827 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms