Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC9O60706 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms