Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PHF1O43189 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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