Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms