Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSEQ9UL01 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms