Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms